Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Lrrc43Q3V0L5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
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Lrrc43Q3V0L5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Lrrc43Q3V0L5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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Lrrc43Q3V0L5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Lrrc43Q3V0L5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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Lrrc43Q3V0L5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrrc43Q3V0L5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
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