Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Garnl3Q3V0G7 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Garnl3Q3V0G7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms