Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3V0E1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q3V0E1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms