Protein–RNA interactions for Protein: Q3V089

Rbm44, RNA-binding protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 1,013 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm44Q3V089 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rbm44Q3V089 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rbm44Q3V089 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms