Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
SvipQ3UZP4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
SvipQ3UZP4 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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