Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWA4

Trim40, Tripartite motif-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim40Q3UWA4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim40Q3UWA4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim40Q3UWA4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103 ms