Protein–RNA interactions for Protein: Q3UK78

Pcgf5, Polycomb group RING finger protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf5Q3UK78 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pcgf5Q3UK78 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms