Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gtpbp2Q3UJK4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gtpbp2Q3UJK4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms