Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Nkx6-3Q3UHX8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nkx6-3Q3UHX8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms