Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHI0

Ccser2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser2Q3UHI0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccser2Q3UHI0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccser2Q3UHI0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms