Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pitpnm3Q3UHE1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms