Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ssbp4Q3U4B1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ssbp4Q3U4B1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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