Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sec24aQ3U2P1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sec24aQ3U2P1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms