Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
XylbQ3TNA1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms