Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Specc1lQ2KN98 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Specc1lQ2KN98 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Specc1lQ2KN98 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Specc1lQ2KN98 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Specc1lQ2KN98 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Specc1lQ2KN98 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Specc1lQ2KN98 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Specc1lQ2KN98 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Specc1lQ2KN98 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Specc1lQ2KN98 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Specc1lQ2KN98 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms