Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gm1123Q1RME4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms