Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd300lgQ1ERP8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms