Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ptchd1Q14B62 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms