Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Rpusd3Q14AI6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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