Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rpusd2Q149F1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms