Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBB0

Prelid2, PRELI domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid2Q0VBB0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prelid2Q0VBB0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prelid2Q0VBB0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms