Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cntnap5bQ0V8T8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms