Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zc3h18Q0P678 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zc3h18Q0P678 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zc3h18Q0P678 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zc3h18Q0P678 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zc3h18Q0P678 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zc3h18Q0P678 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zc3h18Q0P678 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zc3h18Q0P678 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zc3h18Q0P678 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zc3h18Q0P678 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zc3h18Q0P678 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms