Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ssrp1Q08943 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms