Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pou6f1Q07916 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pou6f1Q07916 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms