Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Col17a1Q07563 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Col17a1Q07563 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Col17a1Q07563 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms