Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cntn3Q07409 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cntn3Q07409 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms