Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gdf3Q07104 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms