Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Siah2Q06986 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Siah2Q06986 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms