Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Crisp3Q03402 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms