Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gjb4Q02738 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gjb4Q02738 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms