Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GscQ02591 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GscQ02591 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GscQ02591 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GscQ02591 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GscQ02591 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GscQ02591 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GscQ02591 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms