Protein–RNA interactions for Protein: Q02576

Nhlh1, Helix-loop-helix protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlh1Q02576 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Nhlh1Q02576 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nhlh1Q02576 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms