Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Muc1Q02496 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms