Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb2Q00977 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms