Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Serpina1cQ00896 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Serpina1cQ00896 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms