Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Apoa1Q00623 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Apoa1Q00623 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms