Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Psmb4P99026 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168 ms