Protein–RNA interactions for Protein: P97326

Cdh6, Cadherin-6, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh6P97326 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cdh6P97326 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cdh6P97326 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms