Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gbx1P82976 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms