Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
SgcaP82350 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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