Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Irx3P81067 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Irx3P81067 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms