Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ldb1P70662 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ldb1P70662 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms