Protein–RNA interactions for Protein: P70459

Erf, ETS domain-containing transcription factor ERF, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ErfP70459 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ErfP70459 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ErfP70459 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ErfP70459 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ErfP70459 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ErfP70459 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ErfP70459 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ErfP70459 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ErfP70459 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ErfP70459 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ErfP70459 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ErfP70459 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ErfP70459 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ErfP70459 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ErfP70459 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms