Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vamp7P70280 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vamp7P70280 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms