Protein–RNA interactions for Protein: P70278

Stra8, Stimulated by retinoic acid gene 8 protein, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra8P70278 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Stra8P70278 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stra8P70278 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stra8P70278 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms