Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnab1P63143 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Kcnab1P63143 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.3 ms