Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ufm1P61961 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ufm1P61961 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms