Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Vbp1P61759 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms