Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Stx1bP61264 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Stx1bP61264 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms